El estuario de la Bahía de San Juan tiene un papel único en la NEP. El primer estuario de las islas tropicales para participar en el programa, que contiene las comunidades de coral, pastos marinos, manglares y todos los hábitats designados áreas críticas. El estuario es una de las muchas áreas tropicales tratando de equilibrar las necesidades económicas y la protección de los recursos mediante el turismo ambientalmente sensible. La información obtenida y las lecciones aprendidas en esta NEP pueden ayudar a otros estuarios tropicales en los Estados Unidos y el Caribe.
Desde el punto de vista ecológico, la vela respeta el medio ambiente, transportando a la gente haciendo no más ruido que salpicaduras de agua y utilizando la energía eólica como la principal fuente de energía. La única “contaminación” prevista, es el impacto normal que el “efecto de la vela” tiene sobre el comportamiento de la gente. ¡La navegación puede cambiar sus vidas!